Název: Vizualizace dělení prostoru v dynamických modelech makromolekul
Další názvy: Space Partitioning Visualization in Dynamic Macromolecular Models
Autoři: Šťáva, Oto
Vedoucí práce/školitel: Maňák Martin, Mgr. Ph.D.
Oponent: Hruda Lukáš, Ing.
Datum vydání: 2020
Nakladatel: Západočeská univerzita v Plzni
Typ dokumentu: bakalářská práce
URI: http://hdl.handle.net/11025/41788
Klíčová slova: voroného diagram;počítačová grafika;vizualizace;dělení prostoru;bézierova křivka;opengl;geometry shader;algoritmus de casteljau
Klíčová slova v dalším jazyce: voronoi diagram;computer graphics;visualization;space partitioning;bézier curve;opengl;geometry shader;de casteljau algorithm
Abstrakt: Modelování a vizualizace makromolekulárních struktur proteinů jsou důležitou součástí medicínské informatiky. Tyto vizualizace mohou experti v tomto oboru využívat ke hledání a zkoumání biologicky aktivních míst v těchto molekulách. Ke hledání dutin a tunelů, které mohou představovat možné přístupové cesty k těmto aktivním místům, jsou využívány algoritmy využívající dělení prostoru do Voroného diagramů. Tato práce se zabývá grafickou vizualizací aditivně vážených Voroného diagramů za účelem výzkumu chování těchto diagramů, a to zejména nad dynamickými modely molekul. Součástí práce je softwarová implementace této vizualizace v podobě rozšiřujícího modulu pro aplikaci CAVER Analyst.
Abstrakt v dalším jazyce: Modelling and visualization of macromolecular protein structures play an important part in medical informatics. These visualizations may be used by medical experts to search for and examine biologically active places in these molecules. Existing software solutions use algorithms based on analysis of space partitioning into Voronoi diagrams to find cavities and tunnels, which may be used as potential access paths to those active places. This thesis concerns graphical visualization of additively weighted Voronoi diagrams, which would allow further examination of their behaviour, particularly in dynamically changing molecule models. As a part of the thesis, an extension module for the software application CAVER Analyst visualizing these diagrams was implemented.
Práva: Plný text práce je přístupný bez omezení.
Vyskytuje se v kolekcích:Bakalářské práce / Bachelor´s works (KIV)

Soubory připojené k záznamu:
Soubor Popis VelikostFormát 
BP_Oto_Stava_final.pdfPlný text práce26,32 MBAdobe PDFZobrazit/otevřít
A16B0148P_Hodnoceni.pdfPosudek vedoucího práce27,51 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
A16B0148P_Posudek.pdfPosudek oponenta práce135,67 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
A16B0148P_Obhajoba.pdfPrůběh obhajoby práce82,38 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít


Použijte tento identifikátor k citaci nebo jako odkaz na tento záznam: http://hdl.handle.net/11025/41788

Všechny záznamy v DSpace jsou chráněny autorskými právy, všechna práva vyhrazena.