Full metadata record
DC poleHodnotaJazyk
dc.contributor.advisorMaňák, Martin
dc.contributor.authorMajdišová, Zuzana
dc.contributor.refereeSkála, Jiří
dc.date.accepted2014-06-16
dc.date.accessioned2015-03-25T09:27:00Z-
dc.date.available2013-08-30cs
dc.date.available2015-03-25T09:27:00Z-
dc.date.issued2014
dc.date.submitted2014-05-09
dc.identifier57869
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11025/12535
dc.description.abstractEfektivní analýza biomolekul často vyžaduje popis prostorových vztahů mezi jednotlivými atomy pomocí aditivně váženého Voronoi diagramu, avšak pro velké molekuly a sekvence molekul je získání diagramu časově i paměťově náročné. Cílem práce je prozkoumat možnosti využití vyššího stupně paralelismu GPU k urychlení výpočtu diagramu, navrhnout a implementovat vhodné řešení pro velké molekuly a sekvence. Navržené řešení je založeno na algoritmu trasování hran, přičemž výpočet koncového vrcholu Voronoi hrany je počítán pomocí GPGPU.cs
dc.format62 s.cs
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.language.isocscs
dc.publisherZápadočeská univerzita v Plznics
dc.rightsPlný text práce je přístupný bez omezení.cs
dc.subjectaditivně váženýcs
dc.subjectVoronoics
dc.subjectGPUcs
dc.subjectOpenCLcs
dc.subjectparalelismuscs
dc.titleVyužití paralelismu pro analýzu biomolekulcs
dc.title.alternativeUtilization of parallelism for analysis of biomoleculesen
dc.typediplomová prácecs
dc.thesis.degree-nameIng.cs
dc.thesis.degree-levelNavazujícícs
dc.thesis.degree-grantorZápadočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných vědcs
dc.description.departmentKatedra informatiky a výpočetní technikycs
dc.thesis.degree-programInženýrská informatikacs
dc.description.resultObhájenocs
dc.rights.accessopenAccessen
dc.description.abstract-translatedEffective analysis of biomolecules often requires a description of the spatial relationships between individual atoms using the additively weighted Voronoi diagram. However obtaining such diagrams for large molecules and molecular sequences is a time and memory consuming task. The goal is to explore the possibility of using a higher degree of parallelism offered by GPU to accelerate the computation, and to design and implement appropriate solutions to large molecules and sequences. The proposed solution is based on the edge-tracing algorithm and computes the end vertex of Voronoi edge using GPGPU.en
dc.subject.translatedadditively weighteden
dc.subject.translatedVoronoien
dc.subject.translatedGPUen
dc.subject.translatedOpenCLen
dc.subject.translatedparallelismen
Vyskytuje se v kolekcích:Diplomové práce / Theses (KIV)

Soubory připojené k záznamu:
Soubor Popis VelikostFormát 
vyuziti_paralelismu_pro_analyzu_biomolekul.pdfPlný text práce14,4 MBAdobe PDFZobrazit/otevřít
A11N0142Phodnoceni-ved.pdfPosudek vedoucího práce336,78 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
A11N0142Pposudek-op.pdfPosudek oponenta práce347,4 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
A11N0142Pobhajoba.pdfPrůběh obhajoby práce179,14 kBAdobe PDFZobrazit/otevřít
Zobrazit minimální záznam Zobrazit statistiky


Použijte tento identifikátor k citaci nebo jako odkaz na tento záznam: http://hdl.handle.net/11025/12535

Všechny záznamy v DSpace jsou chráněny autorskými právy, všechna práva vyhrazena.

hledání
navigace
  1. DSpace at University of West Bohemia
  2. Vysokoškolské kvalifikační práce / Theses
  3. Fakulta aplikovaných věd / Faculty of Applied Sciences
  4. Katedra informatiky a výpočetní techniky / Department of Computer Science and Engineering
  5. Diplomové práce / Theses (KIV)