Paralelizace geometrických výpočtů pro analýzu biomolekul

Title:	Paralelizace geometrických výpočtů pro analýzu biomolekul
Authors:	Löffelmann, Václav
Advisor:	Maňák Martin, Mgr. Ph.D.
Referee:	Majdišová Zuzana, Ing. Bc.
Issue Date:	2016
Publisher:	Západočeská univerzita v Plzni
Document type:	bakalářská práce
URI:	http://hdl.handle.net/11025/23828
Keywords:	opencl;connolly surface;molekulární povrch;gpu
Keywords in different language:	opencl;connolly surface;molecular surface;gpu
Abstract:	Bakalářská práce se zabývá paralelním výpočtem molekulárního povrchu v programovacím jazyku OpenCL. Nová implementace dosahuje až 60% zrychlení pro nejobjemnější výpočty. V úvodní části je probrána nezbytná teorie Voronoi diagramů a jejich duální struktury. Následuje shrnutí současné implementace a popis nové, paralelní. V závěru nechybí detailní porovnání výsledků obou implementací napříč různými testovacími daty.
Abstract in different language:	This work examines parallel implementation of exploring the molecular surface. The new implementation is in OpenCL language and improves current implementation by 60% for largest datasets. Initial part sums up a theory about Voronoi diagrams and its dual structure. Following parts targeting difference between current and new - parallel - implementation. At the end are presented detailed results and a comparison of both implementations.
Rights:	Plný text práce je přístupný bez omezení.
Appears in Collections:	Bakalářské práce / Bachelor´s works (KIV)

Files in This Item:

File	Description	Size	Format
bp-loffelmann.pdf	Plný text práce	1,66 MB	Adobe PDF	View/Open
A13B0376P-posudek.pdf	Posudek oponenta práce	617 kB	Adobe PDF	View/Open
A13B0376P-hodnoceni.pdf	Posudek vedoucího práce	184,82 kB	Adobe PDF	View/Open
A13B0376P-obhajoba.pdf	Průběh obhajoby práce	192,79 kB	Adobe PDF	View/Open

Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11025/23828

search

navigation