Title: Workflows pro zpracování elektrofyziologických dat
Other Titles: Workflows for electrophysiological data processing
Authors: Jani, Filip
Advisor: Mouček Roman, Ing. Ph.D.
Referee: Vařeka Lukáš, Ing. Ph.D.
Issue Date: 2020
Publisher: Západočeská univerzita v Plzni
Document type: diplomová práce
URI: http://hdl.handle.net/11025/41749
Keywords: eeg experimenty;zpracování elektrofyziologických dat;workflow management system;python;orange 3;add-on
Keywords in different language: eeg experiments;electrophysiological data processing;workflow management system;python;orange 3;add-on
Abstract: Tato diplomová práce popisuje aktuálně používaný software a pracovní postupy neuroinformatické laboratoře KIV/NTIS na Západočeské univerzitě v Plzni používané pro zpracování elektrofyziologických dat. Protože by členové laboratoře chtěli přejít na kompletně open-source řešení, byla provedena analýza existujících systémů pro správu workflow. Každý systém je hodnocen dle několika kritérií a pro nejvhodnější systém je vytvořena knihovna pro zpracování elektrofyziologických dat. Funkčnost knihovny je následně ověřena na třech existujích experimentech, které byly reprodukovány ve vybraném systému za pomoci vytvořené knihovny. V poslední části jsou hodnoceny výsledky a limitace implementované knihovny.
Abstract in different language: This master's thesis describes current software and workflows at the neuroinformatics lab KIV/NTIS at the University of West Bohemia utilized for electrophysiological data processing. As the lab's members would like to migrate to an utterly open-source solution, an analysis of existing workflows management systems is done. Each is assessed on several factors to fit the neuroinformatics lab's requirements. For the most appropriate system, a custom library for electrophysiological data processing is implemented. The library's functionality is verified on three existing experiments that are reproduced in the chosen system. In the last part, the results and the implemented library's limitations are discussed.
Rights: Plný text práce je přístupný bez omezení.
Appears in Collections:Diplomové práce / Theses (KIV)

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Filip_Jani_DP_2020.pdfPlný text práce4,33 MBAdobe PDFView/Open
A17N0033Phodnoceni-ved.pdfPosudek vedoucího práce423,63 kBAdobe PDFView/Open
A17N0033Pposudek-op.pdfPosudek oponenta práce42,8 kBAdobe PDFView/Open
A17N0033Pobhajoba.PDFPrůběh obhajoby práce290,02 kBAdobe PDFView/Open


Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11025/41749

Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.