Title: | Workflows pro zpracování elektrofyziologických dat |
Other Titles: | Workflows for electrophysiological data processing |
Authors: | Jani, Filip |
Advisor: | Mouček Roman, Ing. Ph.D. |
Referee: | Vařeka Lukáš, Ing. Ph.D. |
Issue Date: | 2020 |
Publisher: | Západočeská univerzita v Plzni |
Document type: | diplomová práce |
URI: | http://hdl.handle.net/11025/41749 |
Keywords: | eeg experimenty;zpracování elektrofyziologických dat;workflow management system;python;orange 3;add-on |
Keywords in different language: | eeg experiments;electrophysiological data processing;workflow management system;python;orange 3;add-on |
Abstract: | Tato diplomová práce popisuje aktuálně používaný software a pracovní postupy neuroinformatické laboratoře KIV/NTIS na Západočeské univerzitě v Plzni používané pro zpracování elektrofyziologických dat. Protože by členové laboratoře chtěli přejít na kompletně open-source řešení, byla provedena analýza existujících systémů pro správu workflow. Každý systém je hodnocen dle několika kritérií a pro nejvhodnější systém je vytvořena knihovna pro zpracování elektrofyziologických dat. Funkčnost knihovny je následně ověřena na třech existujích experimentech, které byly reprodukovány ve vybraném systému za pomoci vytvořené knihovny. V poslední části jsou hodnoceny výsledky a limitace implementované knihovny. |
Abstract in different language: | This master's thesis describes current software and workflows at the neuroinformatics lab KIV/NTIS at the University of West Bohemia utilized for electrophysiological data processing. As the lab's members would like to migrate to an utterly open-source solution, an analysis of existing workflows management systems is done. Each is assessed on several factors to fit the neuroinformatics lab's requirements. For the most appropriate system, a custom library for electrophysiological data processing is implemented. The library's functionality is verified on three existing experiments that are reproduced in the chosen system. In the last part, the results and the implemented library's limitations are discussed. |
Rights: | Plný text práce je přístupný bez omezení. |
Appears in Collections: | Diplomové práce / Theses (KIV) |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
Filip_Jani_DP_2020.pdf | Plný text práce | 4,33 MB | Adobe PDF | View/Open |
A17N0033Phodnoceni-ved.pdf | Posudek vedoucího práce | 423,63 kB | Adobe PDF | View/Open |
A17N0033Pposudek-op.pdf | Posudek oponenta práce | 42,8 kB | Adobe PDF | View/Open |
A17N0033Pobhajoba.PDF | Průběh obhajoby práce | 290,02 kB | Adobe PDF | View/Open |
Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11025/41749
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.