| Title: | Systematické řízení dostupnosti metabolitů pomocí modelů a metod syntetické biologie |
| Other Titles: | Systematic control of metabolite availability using models and methods of synthetic biology |
| Authors: | Zach, Pavel |
| Advisor: | Georgiev, Daniel |
| Referee: | Vignoni, Alejandro |
| Issue Date: | 2014 |
| Publisher: | Západočeská univerzita v Plzni |
| Document type: | diplomová práce |
| URI: | http://hdl.handle.net/11025/12341 |
| Keywords: | syntetická biologie;regulace operonu;simultánní transkripce a translace;RNA regulační elementy;Escherichia coli |
| Keywords in different language: | synthetic biology;operon regulation;transcriptional-translational coupling;RNA regulatory elements;Escherichia coli |
| Abstract: | Cílem této práce je návrh univerzální programovatelné platformy pro regulaci operonů s využitím měření hladin metabolitů. V první části je uveden přehled mechanismů, které využívají bakterie, společně s alternativami ze syntetické biologie. Jednotlivé role těchto mechanismů jsou vyšetřeny simulacemi fyzikálně relevantních matematických modelů. Ve druhé části jsou uvedeny výhody využití měření metabolitů. Třetí část je pak věnována systémovému návrhu syntetických částí využívajících simultánní transkripce-translace v prokaryotech a měření hladiny metabolitů. V poslední části této práce je pro tyto části vytvořen a validován obecný model. |
| Abstract in different language: | The goal of this thesis is to design a versatile and programmable operon regulation platform using metabolic intermediate measurements. In the first part, the regulatory mechanisms implemented by bacteria are reviewed, together with the synthetic biology design alternatives. The roles of these mechanisms are investigated using simulations of physically relevant mathematical models. In the second part, the advantages of using the metabolic measurements are shown. The third part is dedicated to systematic design of transcriptional-translational coupling devices that regulate operon expression using metabolic measurements. In the last section, a corresponding general model is developed and validated. |
| Rights: | Plný text práce je přístupný bez omezení. |
| Appears in Collections: | Diplomové práce / Theses (KKY) |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| ing-thesis-pavel-zach.pdf | Plný text práce | 1,54 MB | Adobe PDF | View/Open |
| Zach-v.pdf | Posudek vedoucího práce | 2,53 MB | Adobe PDF | View/Open |
| Zach-o.pdf | Posudek oponenta práce | 4,38 MB | Adobe PDF | View/Open |
| Zach-p.pdf | Průběh obhajoby práce | 1,3 MB | Adobe PDF | View/Open |
Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11025/12341Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.